Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip11E9Q512 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms