Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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