Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd1E9Q3H4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms