Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp1E9Q368 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms