Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms