Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hectd4E9Q2E4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms