Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms