Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3250E9Q1M3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms