Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3893E9Q1I1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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