Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N2

Ptprh, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprhE9Q0N2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprhE9Q0N2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprhE9Q0N2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms