Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gcom1E9PZ54 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms