Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp4E9PYK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms