Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsf1E9PWW9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsf1E9PWW9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsf1E9PWW9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsf1E9PWW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsf1E9PWW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsf1E9PWW9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms