Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dchs1E9PVD3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms