Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FgaE9PV24 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms