Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU019823E9PUQ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU019823E9PUQ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms