Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde2E9PUP1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms