Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms