Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms