Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3676D3Z236 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms