Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3543D3Z235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3543D3Z235 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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