Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc6D3YZP9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc6D3YZP9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms