Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC048679D3YXE9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms