Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap70D3YVL2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap70D3YVL2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms