Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms