Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rfx8D3YU81 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx8D3YU81 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfx8D3YU81 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx8D3YU81 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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