Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna7C0LLJ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms