Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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