Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatipB9EKE5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CatipB9EKE5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CatipB9EKE5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatipB9EKE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatipB9EKE5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatipB9EKE5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms