Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms