Protein–RNA interactions for Protein: B6A8R8

Tarm1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarm1B6A8R8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarm1B6A8R8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms