Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms