Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms