Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms