Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4787B2RUD9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4787B2RUD9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4787B2RUD9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4787B2RUD9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4787B2RUD9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4787B2RUD9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4787B2RUD9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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