Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms