Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf518bB2RRE4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf518bB2RRE4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms