Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed5B2RPU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed5B2RPU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms