Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms