Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms