Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scml2B1AVB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms