Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NhsB1AV60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NhsB1AV60 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms