Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grik3B1AS29 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms