Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr29B1ARI9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms