Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms