Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprsB0V2N1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms