Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2A3KGV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2A3KGV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms