Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Btbd35f28A2CFD5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms