Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930402F06RikA2AUQ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930402F06RikA2AUQ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms