Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SktA2AQ25 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SktA2AQ25 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms